Nữ sinh viên khoa luật Stella James lên tiếng tố cáo ông Ganguly tìm cách lôi kéo cô vào một phòng của khách sạn Le Meridien ở New Delhi vào ngày 24.12.2013. Bản thân vị thẩm phán bác bỏ tất cả những buộc tội.

Tuy nhiên, Ủy ban của Tòa án Tối cao điều tra vụ việc, đã xác nhận có bằng chứng đầy đủ về "hành vi vô liêm sỉ" của cựu thẩm phán. Song tòa án không có bất kỳ biện pháp với ông Ganguly, vì đến thời điểm đó ông không còn là thẩm phán.

Sau khi thôi việc tại Tòa án Tối cao, ông Ganguly được bổ nhiệm làm Chủ tịch Ủy ban Nhân quyền bang Tây Bengal.